ESPript 2.3のLinuxコマンドラインでの使い方

Linuxへのインストールの仕方は以前の記事参照


ESPriptの実行

$ ESPript

対話式にパラメーターを入力していく。

とりあえず、動かしたい。

1. Alignment file from MULTALIN/CLUSTAL/MUSCLE/GCG/SEAVIEW/MAXHOM/THREADER/PDB
    with possibility PDB file for score in Bfac column
    or list of intermolecular contacts generated with CNS:
 file.aln [fragment(5-50)] [first residue(1)] [continue(+)] file.pdb cns.list
hogehoge.aln ←アライメントファイルの場所を入力する。

    

  • > File to open: hogehoge.aln 
    • 

.
.
.（以下ずっとリターン）

ポストスクリプトファイルが生成される。

hogehoge.ps

ポストスクリプトファイルをPDFファイルに変換する。

$ ps2pdf hogehoge.ps

hogehoge.pdfが生成される。

適当なPDFリーダーで読む。
例：Acrobat Readerの場合

$ acroread hogehoge.pdf