２次構造計算サーバDSSPでエラーが出た時

PDBファイル形式の構造データから２次構造を計算してくれるDSSPで以下のようなエラーが出ることがある。

Error
Something went wrong processing your request.
basic_string::substr

PDBファイルのATOMエントリーが規定通りの形式ではないために起こる。
ATOMエントリーは規定では８０行目までデータが書き込まれている参照.

DSSPは５４行目の座標情報までしか必要としないが、その後にすぐ改行があったりするとエラーとなる。
上記のようなエラーが出た場合は行末に適当な空白を付加すれば良い。

例えばviでは

:500,200 s/$/            /

:ATOMエントリーの最初の行番号,終わりの行番号 s/$/  （適当なスペース）                            /