lzma形式のファイルを解凍・圧縮する。(OpenSUSE11.1の場合) 解凍 >unlzma ファイル.lzma 圧縮 >lzma 圧縮したいファイル #圧縮したいファイル.lzmaができる .tar.lzma(または.tlz)形式のファイルを解凍・圧縮する (OpenSUSE 11.1付属のtar 1.20で解凍・圧縮…

Windows版PymolでAPBSを使って静電ポテンシャルを描く方法その１（APBSを使わずに、とりあえず表示させたい場合)はこちら Pymolに静電ポテンシャルを表示するAPBS tools プラグインはすでに入っているが、静電ポテンシャルを計算するAPBSをインストールする…

とりあえず、面倒な設定なしで表示させたい！というときは、PymolにあるVaccume Electrostatisticsを使えば表示できます。 ●Pymolをご利用になったことがない方へPymolの使い方は、ライフサイエンス統合データベースセンターが公開している以下のムービーな…

modellerでModellerの基本的使い方1のようにファイルを用意して、いざ実行してみると以下のようなエラーがでて計算が開始されないことがあります。 read_te_290E> Number of residues in the alignment and pdb files are different: 152 146 For alignment …

NMRスペクトルプロセッシングソフトのNMRPipeにはcsh用の設定ファイルしか用意されてないため、bashやzshからは起動できません。 しかし、「漢ならばzshからも起動させたいものだ」と諸兄も考えていることと思います。NMRPipeをbash/zshから起動させるにはcs…

タンパク質のホモロジーモデリングソフトModellerの使い方 (Linux/MacOSXの場合)以下のチュートリアルにあるBasic Exampleの要約 http://salilab.org/modeller/tutorial/basic.html チュートリアルによると、modellerの使用方法は簡単だそうです。 ※ただし、…

＊このページは自分のメモを載せただけで、わかりにくい記述があるのでそのうちなんとかします。追記：たまに書き換えてますModellerのインストール方法 (Linux/MacOS X) http://www.salilab.org/modeller/ ダウンロード 以下から、使用パソコンに適したコン…